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高等研究院李猛教授團隊在國際微生物學權(quán)威期刊Microbiome發(fā)表論文

來源: 發(fā)布時間:2018-06-13 11:59 點擊數(shù): Views

近日,高等研究院李猛教授團隊在烏斯古菌(Woesearchaeota)生態(tài)分布、進化及生理代謝研究方面取得了新進展。研究工作以“Insights into the ecology, evolution, and metabolism of the widespread Woesearchaeotal lineages”為題發(fā)表在微生物學權(quán)威刊物Microbiome。李猛教授與香港大學顧繼東教授為共同通訊作者,香港大學博士生劉小波(由李猛老師與顧繼東老師共同指導)為第一作者,深圳大學為第二完成單位和通訊單位, 加州大學伯克利分校著名微生物學家Jill Banfield等為共同作者。

自1977年Carl Woese提出“三域?qū)W說”,將地球生物劃分為Achaea (古菌),Bacteria (細菌), Eukarya (真核生物)。古菌研究是微生物界熱點話題之一,已由最初的2個門(phylum)發(fā)展到如今28個。為紀念Carl Woese對生物進化分類學突出貢獻,Jill Banfield等將DPANN超級古菌門中一個新發(fā)現(xiàn)古菌門命名為Woesearchaeota(烏斯古菌),并揭示該古菌在厭氧碳循環(huán)過程中扮演著極為重要的角色。然而,烏斯古菌作為一類重要的古菌,其生態(tài)分布、進化及代謝功能鮮有報到。課題組基于這一類古菌的全球分布統(tǒng)計、進化分析、基因組和功能代謝預測研究為烏斯古菌的生態(tài)分布、進化分類及其代謝潛能奠定了新的基礎。李猛教授團隊與香港大學生物科學學院顧繼東教授、加州大學貝克利分校Jill Banfield教授、德國杜伊斯堡-埃森大學Alexander J. Probst教授合作,采用生物信息學技術(shù)手段,從進化角度將該古菌劃分為26個亞群。通過基因組分析發(fā)現(xiàn),烏斯古菌具有高度代謝缺陷(圖1),很可能通過代謝互補方式與產(chǎn)甲烷古菌存在共生關(guān)系(圖2)。研究結(jié)果對于認識烏斯古菌在生態(tài)環(huán)境中的作用,尤其是甲烷產(chǎn)生等方面都有十分重要的意義。

 

研究得到了國家自然科學基金、廣東省自然科學基金和深圳市科創(chuàng)委基礎研究項目及孔雀技術(shù)創(chuàng)新項目等多項基金的支持。

論文鏈接:https://doi.org/10.1186/s40168-018-0488-2

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