2024年1月10日，

李猛教授為論文通訊作者，深圳大學-香港科技大學聯合培養項目博士研究生段昌海為該論文的第一作者。

深古菌是一類廣泛分布于厭氧沉積物環境中的微生物。由于其具有高的全球生物量、廣泛的生態分布及復雜的碳代謝能力，深古菌在全球碳循環中可能發揮著重要作用。然而，病毒對微生物的生理和生態功能會產生重大影響。因此，研究深古菌病毒的多樣性以及其與宿主的相互作用關系，可以幫助我們更全面地了解深古菌的生態功能，同時也為研究宿主與病毒之間的防御機制提供了基礎。

李猛教授團隊采集了大量公共數據庫中以及實驗室特有的深古菌基因組，利用生物信息學方法，鑒定得到了4類屬于不同科的古菌病毒。通過系統發育分析發現，這些病毒分屬于兩個不同的病毒域以及一個古菌特有的病毒科。為了弘揚中國經典文化，該團隊以山海經中的神話人物為這些病毒命名，包括伏羲病毒科（Fuxiviridae）、鯤鵬病毒科（Kunpengviridae）、蚩尤病毒科（Chiyouviridae）和黃帝病毒科（Huangdiviridae）。分析還發現，這些深古菌病毒基因組中含有多個CRISPR-Cas系統元件的基因，包括編碼一個特異的Type IV-B CRISPR-Cas系統及cas2和cas4蛋白。此外，研究人員還在病毒基因組中發現了mini-CRISPR array，為后續病毒反防御機制的研究打開了新的思路。

該研究得到了國家重點研發計劃（2022YFA0912200）、國家自然科學基金（32225003、92251306、31970105）、廣東省教育廳創新團隊（No. 2020KCXTD023）、深圳市科技計劃（JCYJ20200109105010363）以及深圳大學2035追求卓越研究計劃（2022B002）等項目的資助。

論文鏈接：https://doi.org/10.1093/ismeco/ycad011

圖1 深古菌病毒的多樣性及其宿主的防御系統

（來源 深圳大學高等研究院）